非編碼基因組比編碼蛋白質(zhì)基因組大很多,但遺傳關(guān)聯(lián)的研究探索很少。以色列魏茨曼科學(xué)研究所研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),白細(xì)胞介素18受體輔助蛋白3‘非編碼區(qū)的變體可預(yù)防肌萎縮側(cè)索硬化癥(Amyotrophic Lateral Sclerosis,ALS)。近日,該項(xiàng)研究成果發(fā)表在《Nature Neuroscience》上,題為:Whole-genome sequencing reveals that variants in the Interleukin 18 Receptor Accessory Protein 3′UTR protect against ALS。
研究人員對超過25000個變體進(jìn)行了基于區(qū)域的變體關(guān)聯(lián)分析,這些變體源自6139個ALS患者和用于對照的70403個非ALS患者的全基因組的非編碼區(qū)。他們確定了白細(xì)胞介素18受體輔助蛋白(IL18RAP)3’非編碼區(qū)(3‘UTR)變體在非ALS基因組中顯著富集,與患ALS的風(fēng)險降低有關(guān)。該結(jié)果在一個獨(dú)立的隊列中得到了驗(yàn)證。這些IL18RAP 3’UTR中的變體降低了信使核糖核酸(mRNA)的穩(wěn)定性和雙鏈核糖核酸(dsRNA)結(jié)合蛋白的結(jié)合能力。此外,IL18RAP 3‘UTR的變體抑制了人類誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)分化的小膠質(zhì)細(xì)胞在編碼預(yù)測的鳥嘌呤交換因子(C9orf72)中具有ALS相關(guān)擴(kuò)增的神經(jīng)毒性,使得運(yùn)動神經(jīng)元更好地存活。
綜上所述,該研究揭示了遺傳變異可以通過減少神經(jīng)炎癥來預(yù)防ALS,并強(qiáng)調(diào)非編碼基因組在遺傳關(guān)聯(lián)研究中的重要性。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41593-022-01040-6
注:此研究成果摘自《Nature Neuroscience》雜志,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場,僅供參考。
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