環(huán)形RNA(circRNA)是一類在真核細(xì)胞中廣泛存在的內(nèi)源性非編碼RNA分子。單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展,可以對單個細(xì)胞中環(huán)形RNA進行捕獲測定,但效率較低,僅可部分揭示單細(xì)胞分辨率下環(huán)形RNA的表達模式。因此,單細(xì)胞水平的環(huán)形RNA表達及功能研究已成為該領(lǐng)域重點關(guān)注的問題。
近期,中國科學(xué)院北京生命科學(xué)研究院的科研團隊在《Nature Communications》期刊上發(fā)表了題為“Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing”的研究論文,建立了單細(xì)胞環(huán)形RNA分析技術(shù)及表達圖譜。
該研究基于171個已發(fā)表的單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)集,實現(xiàn)了單細(xì)胞分辨率下環(huán)形RNA的高效識別及深度挖掘,基于大規(guī)模時空組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析,對環(huán)形RNA的細(xì)胞異質(zhì)性進行了深入探究,揭示了環(huán)形RNA作為細(xì)胞類型標(biāo)志物的應(yīng)用潛力,構(gòu)建了目前首個單細(xì)胞環(huán)形RNA數(shù)據(jù)分析和資源平臺,為環(huán)形RNA研究提供了獨特而重要的數(shù)據(jù)和技術(shù)基礎(chǔ)。
該研究將目前環(huán)形RNA研究從傳統(tǒng)組織水平提升至單細(xì)胞水平,為探索不同細(xì)胞類型中環(huán)形RNA的生物學(xué)功能提供了重要的數(shù)據(jù)資源和分析技術(shù)。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-022-30963-8
注:此研究成果摘自《Nature Communications》期刊,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場,僅供參考。
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