科學(xué)家發(fā)現(xiàn)基因組學(xué)在海洋細(xì)菌研究方面的應(yīng)用潛力

基因簇是指結(jié)構(gòu)和功能相似的同一家族的成員基因，簇狀排列在染色體上相對(duì)集中區(qū)域的現(xiàn)象。近期，瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的研究團(tuán)隊(duì)借助基因組學(xué)技術(shù)，發(fā)現(xiàn)了多種海洋細(xì)菌生物合成基因簇，未來可能為相關(guān)領(lǐng)域研究提供啟示。相關(guān)成果在《Nature》發(fā)表，論文的標(biāo)題為：Biosynthetic potential of the global ocean microbiome。

研究團(tuán)隊(duì)首先獲取了全球215個(gè)采樣點(diǎn)的不同深度層共1038個(gè)海水樣本的基因測(cè)序數(shù)據(jù)，構(gòu)建了26293種海洋微生物基因組，其中2790種來自新發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌。結(jié)合已公布的基因組數(shù)據(jù)，研究人員創(chuàng)建了海洋微生物組學(xué)數(shù)據(jù)庫（OMD，Ocean Microbiomics Database），通過復(fù)雜的算法分析發(fā)現(xiàn)了39055個(gè)生物合成基因簇（BGCs，biosynthetic gene clusters），參與約6873種化合物的生物合成過程。進(jìn)一步研究表明部分基因簇在亞磷酸鹽等化合物的生物合成中起著關(guān)鍵作用。

該研究通過基因組學(xué)方法發(fā)現(xiàn)了新型海洋細(xì)菌和生物合成基因簇，對(duì)海洋生態(tài)、生物進(jìn)化和天然產(chǎn)物等領(lǐng)域的研究具有重要意義。

論文鏈接：

https://doi.org/10.1038/s41586-022-04862-3

注：此研究成果摘自《Nature》，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場(chǎng)。

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