科學(xué)家開發(fā)出對菌群中單個細菌進行高通量鑒定和定量的新技術(shù)

細菌以菌群的形式廣泛存在于地球上，了解菌群中細菌的組成和數(shù)量，對于研究菌群功能以及菌群如何影響宿主穩(wěn)態(tài)等問題至關(guān)重要。然而，目前的技術(shù)難以在單菌水平上測定菌群組成。近期，日本科學(xué)家開發(fā)了一種對菌群中單個細菌進行高通量鑒定和定量的新技術(shù)，研究成果發(fā)表在《Nature Communications》期刊，標題為“High-throughput identification and quantification of single bacterial cells in the microbiota”。

這項技術(shù)被命名為BarBIQ（Barcoding Bacteria for Identification and Quantification，細菌條形碼鑒定和定量技術(shù)），它基于16S rRNA基因測序和單細胞標簽等技術(shù)，將單個細菌細胞進行分類群鑒定，并以高通量的方式對每個分類群進行量化，且實現(xiàn)了單堿基精度?？蒲腥藛T將該技術(shù)應(yīng)用于小鼠腸道微生物群研究中，鑒定并量化了來自小鼠糞便的3.4×105個細菌細胞的810個分類群，并發(fā)現(xiàn)了膳食維生素A缺乏下小鼠盲腸內(nèi)菌群的微小變化。

BarBIQ可以準確可視化整體菌群和單個細菌，且具有高通量的優(yōu)勢，為開展菌群相關(guān)的廣泛研究提供了新的工具。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28426-1

注：此研究成果摘自《Nature Communications》期刊，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場，僅供參考。

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