我國科學(xué)家繪制小鼠器官發(fā)生的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)是研究復(fù)雜生物過程（如哺乳動物的胚胎發(fā)育）的工具。然而，目前的方法受分辨率、基因捕獲區(qū)域和觀察視野等限制，無法用于分析體積較大、三維的妊娠中期和晚期胚胎研究。利用DNA納米球陣列芯片和原位mRNA捕獲技術(shù)，深圳華大基因研究院等研究團(tuán)隊繪制了小鼠器官發(fā)生的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜。該論文近日發(fā)表在《Cell》雜志上，題為：Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays。

研究人員綜合運用DNA納米球陣列芯片和原位mRNA捕獲技術(shù)，創(chuàng)建了空間增強分辨率的全基因組測序技術(shù)（Stereo-seq）。該測序技術(shù)具有單細(xì)胞分辨率和高靈敏度，他們應(yīng)用該技術(shù)繪制了小鼠器官發(fā)育的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜（MOSTA），描繪了發(fā)育過程中轉(zhuǎn)錄組的變化和動力學(xué)特征。利用這些信息，研究人員深入了解了發(fā)育組織的空間分布以及細(xì)胞命運調(diào)控過程的分子基礎(chǔ)，如發(fā)現(xiàn)背側(cè)中腦組織在不同胚胎時間點，祖細(xì)胞與其分化細(xì)胞存在空間分布異質(zhì)性。

總之，該研究繪制的全景圖譜將有助于深入研究哺乳動物正常或異常發(fā)育涉及的相關(guān)問題。

論文鏈接：

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00399-3

注：此研究成果摘自《Cell》雜志，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場，僅供參考。

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