科學(xué)家開(kāi)發(fā)了一種能夠?qū)崿F(xiàn)表觀遺傳組-轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析的新技術(shù)

單細(xì)胞多組學(xué)，尤其是染色質(zhì)可及性表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄組同時(shí)測(cè)序分析，不僅可以鑒別細(xì)胞類型和狀態(tài)，還可以揭示控制基因表達(dá)的機(jī)理，被視為單細(xì)胞組學(xué)分析的極致利器。而隨著空間組學(xué)的興起，空間多組學(xué)技術(shù)（spatial multi-omics）是否可以同時(shí)分析基因表達(dá)和基因調(diào)控機(jī)制，已成為全球矚目熱點(diǎn)，還曾被《Nature》雜志展望為2022年最值得期待的七項(xiàng)技術(shù)之一。

近期，美國(guó)耶魯大學(xué)和瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一項(xiàng)最新的空間多組學(xué)技術(shù)，成功實(shí)現(xiàn)了同一組織樣本上總體染色質(zhì)可及性和基因表達(dá)的聯(lián)合空間組學(xué)分析（Spatial ATAC-RNA-seq），并同時(shí)報(bào)道了三種特定組蛋白修飾和基因表達(dá)的聯(lián)合分析（Spatial CUT＆Tag-RNA-seq）。與單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合分析顯示，這些技術(shù)達(dá)到了細(xì)胞水平或接近單細(xì)胞分辨率。該團(tuán)隊(duì)希望后續(xù)將該技術(shù)應(yīng)用于各種組織類型，并生成表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄狀態(tài)的空間圖譜，以空間和全基因組水平為視角，深入探尋表觀遺傳機(jī)制在組織內(nèi)掌控轉(zhuǎn)錄表型和細(xì)胞動(dòng)態(tài)的奧秘。相關(guān)研究結(jié)果于2023年3月15日以“Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues”為題發(fā)表在《Nature》雜志上。

注：此研究成果摘自《Nature》，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場(chǎng)。

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