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研究人員揭示環(huán)狀RNA或可成為阿爾茲海默癥的臨床新指標(biāo)

    2019年10月7日,來(lái)自美國(guó)華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Carlos Cruchaga教授研究團(tuán)隊(duì)在Nature Neuroscience上在線發(fā)表題為“An atlas of cortical circular RNA expression in Alzheimer disease brains demonstrates clinical and pathological associations”的文章,對(duì)阿爾茨海默癥(AD)患者中環(huán)狀RNA(circRNA)的差異表達(dá)及其與AD臨床和神經(jīng)病理學(xué)嚴(yán)重程度的關(guān)系進(jìn)行了全circRNA轉(zhuǎn)錄組分析,為我們解答了上述問(wèn)題,提出circRNA與AD發(fā)生發(fā)展進(jìn)展關(guān)系密切,并有望成為臨床早期診斷的新靶標(biāo)。

    本文研究人員通過(guò)相對(duì)重要性分析、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析和miRNA結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)分析,探討AD相關(guān)circRNA的AD相關(guān)性和潛在的疾病影響機(jī)制。結(jié)果顯示,與已知的兩個(gè)因素——APOE4等位基因的數(shù)量(AD最常用的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子)和神經(jīng)元估計(jì)比例——相比,circRNA的變化能更好的反映AD特征;此外,AD相關(guān)的circRNA與已知的AD基因存在共表達(dá)關(guān)系,并且這些circRNA存在潛在的microRNA結(jié)合位點(diǎn),可以用于預(yù)測(cè)以AD基因?yàn)榘悬c(diǎn)的microRNA。

    本研究證實(shí),即使沒(méi)有人口統(tǒng)計(jì)學(xué)或APOE4危險(xiǎn)因素?cái)?shù)據(jù),circRNA的表達(dá)也能對(duì)AD的病情產(chǎn)生很強(qiáng)的預(yù)測(cè)能力;同時(shí),結(jié)合circRNA在腦脊液和血漿等生物體液中的相對(duì)穩(wěn)定性以及它們?cè)谕饷隗w中的富集的特點(diǎn),circRNA也可能會(huì)被用作癥狀前和癥狀性AD以及其他潛在的神經(jīng)退行性疾病的外周生物標(biāo)志物;由此,進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了分析非線性RNA的重要性,并為未來(lái)探索circRNA在AD發(fā)病機(jī)制中的潛在作用的研究提供了方向。

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